Durch die besondere geografische Lage mit seinem tiefen Fahrwasser von Seekartennull (SKN) -18,1 m und der kurzen Revierfahrt von 23 Seemeilen können in Wilhelmshaven Schiffe aller Größenklassen abgefertigt, Massen- und Stückgut aller Art sowie Container umgeschlagen werden.
Wilhelmshaven ist Energiedrehscheibe und Deutschlands größter Importhafen für Rohöl. Zudem ist der Hafen Umschlagplatz u. a. für Mineralölerzeugnisse und chemische Produkte.